Crea desde cero modelos de nicho ecológico para especies mediante
R y Maxent integrados con Sistemas de Información Geográfica.
En este curso de 11 Módulos dominarás los conceptos, hipótesis, y aspectos metodológicos más importantes y necesarios para aplicar los modelos de nicho según tu campo de interés siempre con la robustez técnica y científica que se requiere en proyectos de investigación.
Aprenderás a utilizar R para manipular bases de datos y su integración con SIG, así como el uso de Arcgis Pro para realizar los mismos procesos que en R y desarrollar tus modelos de nicho ecológico.
Finalmente, cómo proyecto final, crearás tus propios modelos de nicho ecológico y estarás en la capacidad de interpretar tus resultados aplicando técnicas de post-procesamiento de acuerdo a los principales campos de investigación y aplicaciones.
Este curso es para personas CON o SIN conocimientos previos y empezamos desde CERO.
UNIDAD 1. GENERALIDADES DEL CURSO
| 1.1. Bienvenida al curso |
| 1.2. Presentación estudiantes |
| 1.3. Uso de la plataforma |
UNIDAD 2. INTRODUCCIÓN MODELO NICHO ECOLÓGICO
| 2.1. Biodiversidad y Bigdata |
| 2.2. Qué es un modelo de nicho |
| 2.3. Aplicaciones |
UNIDAD 3. BASES FUNDAMENTALES PARA MODELADO DE NICHO ECOLÓGICO.
| 3.1. Conceptos de nicho |
| 3.2. El concepto de área de distribución |
| 3.3. La dualidad de Hutchinson |
| 3.4. Práctica: Dualidad de Hutchinson (demostración) |
| 3.5. Métodos para estimar areas de distribución |
| 3.6. Las unidades de modelado ¿Qué estamos modelando? |
| 3.7. El diagrama BAM y sus configuraciones |
| 3.8. Algoritmos |
| 3.9. MAXENT |
| 3.10. Elipsoides |
| 3.11. MDE vs MNE |
UNIDAD 4. SIG Y HERRAMIENTAS BÁSICAS PARA REALIZAR MNE
| 4.1. ¿Qué son los SIG? |
| 4.2. Coordenadas, Sistema de coordenadas de referencia, uso de GPS |
| 4.3. Teoría: Formatos vectorial y raster |
| 4.4. Introducción a la interfaz de Arcgis |
| 4.5. Práctica: Formatos vectorial y raster (cargar archivos) |
| 4.6. Práctica: Edición y creación de shapefile, simbología de capas raster |
| 4.7. Práctica: Cargar puntos al arcgis desde una base de datos |
| 4.8. Herramientas básicas para MNE |
| 4.9. Práctica: SDM Tools |
UNIDAD 5. INTRODUCCIÓN A R COMO SIG
| 5.1. Beneficios de usar R como SIG |
| 5.2. Instalación de R y paquetes |
| 5.3. Práctica: Ejercicos básicos de R |
| 5.4. Práctica: Manipulación de dataframes |
| 5.5. Práctica: Estadisticos descriptivos |
UNIDAD 6. DATOS BIOLÓGICOS
| 6.1. Portales y tipos de datos |
| 6.2. Práctica: Descarga de datos de presencia 1 |
| 6.3. Práctica: Descarga de datos de presencia 2 |
| 6.4. Preprocesamiento de datos |
| 6.5. Práctica: Preprocesamiento 1: Georreferenciación |
| 6.6. Práctica: Preprocesamiento 2: Atípicos climáticos y geográficos |
| Ejercicio estudiantes: estudio de caso |
UNIDAD 7. INFORMACIÓN AMBIENTAL
| 7.1. Tipos de variables |
| 7.2. Calidad de la información, resolución espacial y temporal |
| 7.3. Portales y obtención de datos |
| 7.4. Práctica: descarga de capas con R |
UNIDAD 8. ÁREA DE ACCESBILIDAD (M)
| 8.1. Definición del área de accesibilidad |
| 8.2. Métodos para establecer la M |
| 8.3. Práctica: Establecer la M |
| Ejercicio estudiantes: estudio de caso |
UNIDAD 9. CALIBRACIÓN Y EVALUACIÓN DE LOS MODELOS.
| 9.1. Calibración 1: Registros para prueba y entrenamiento |
| 9.2. Práctica: Partición de datos de training y testing |
| 9.3. Calibración 2: Elección de variables para generar modelos |
| 9.4. Práctica: Correlación de pearson, Jackknife y biología |
| 9.5. Práctica: Analisis de componentes principales |
| 9.6. Teoría: Parametrización del modelo |
| 9.7. Teoría: Evaluación de los modelos |
UNIDAD 10. GENERACIÓN DE MODELOS DE NICHO.
| 10.1. Objetivo del estudio |
| 10.2. Teoría: Conservadurismo de nicho |
| 10.3. Teoría: Transferencia de modelos 1 (Transferencias a otras áreas) |
| 10.4. Teoría: Transferencia de modelos 2 (Transferencias a otros tiempos 1) |
| 10.5. Teoría: Transferencia de modelos 3 (Transferencias a otros tiempos 2) |
| 10.6. Práctica: Interfaz de Maxent |
| 10.7. Práctica: Paquete Kuenm 1 |
| 10.8. Práctica: Paquete Kuenm 2 |
| 10.9. Práctica: Paquete Wallace |
| 10.10. Práctica: Paquete Ntbox 1 |
| 10.11. Práctica: Paquete Ntbox 2 |
| 10.12. Teoría: Similitud de nicho |
| 10.13. Práctica: Comparación de nichos |
| 10.14. Teoría: Modelo de nicho a traves de elipsoides |
| 10.15. Práctica: Paquete Ellipsem |
| Estudio de caso 1: Determinar la distribución de una especie |
| Estudio de caso 2: Cambio climatico |
| Estudio de caso 3: Especies invasoras |
UNIDAD 11. PROYECTO FINAL
| Propuesta de trabajo de alumnos |
| Resultados del trabajo |
Genera métricas estadísticas del paisaje por medio de los Sistemas de Información Geográfica y toma decisiones acertadas en pro del medio ambiente y la biodiversidad.
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Biólogo titulado de la Universidad de Antioquia – Magíster en Ciencias, INECOL – Laboratorio de Bioclimatología, Profesional con amplio conocimiento en el estudio de anfibios y reptiles, principalmente a nivel de ecología espacial y temporal. Amplia experiencia en manejo de sistemas de información geográfica, geoestadistíca espacial y modelado de nicho ecológico principalmente con fines de investigación con ArcGIS, Maxent y el lenguaje de programación de R.
Experiencia como consultor ambiental en diferentes proyectos ambientales (líneas base, ahuyentamiento y monitoreo).
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